Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
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