Protein–RNA interactions for Protein: Q49AH0

CDNF, Cerebral dopamine neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDNFQ49AH0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDNFQ49AH0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDNFQ49AH0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDNFQ49AH0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDNFQ49AH0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDNFQ49AH0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDNFQ49AH0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDNFQ49AH0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDNFQ49AH0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDNFQ49AH0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDNFQ49AH0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDNFQ49AH0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDNFQ49AH0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDNFQ49AH0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDNFQ49AH0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDNFQ49AH0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDNFQ49AH0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDNFQ49AH0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDNFQ49AH0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDNFQ49AH0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms