Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms