Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TWISTNBQ3B726 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TWISTNBQ3B726 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TWISTNBQ3B726 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TWISTNBQ3B726 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TWISTNBQ3B726 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TWISTNBQ3B726 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TWISTNBQ3B726 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TWISTNBQ3B726 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TWISTNBQ3B726 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TWISTNBQ3B726 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TWISTNBQ3B726 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TWISTNBQ3B726 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TWISTNBQ3B726 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TWISTNBQ3B726 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TWISTNBQ3B726 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TWISTNBQ3B726 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TWISTNBQ3B726 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TWISTNBQ3B726 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TWISTNBQ3B726 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TWISTNBQ3B726 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TWISTNBQ3B726 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TWISTNBQ3B726 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
TWISTNBQ3B726 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TWISTNBQ3B726 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TWISTNBQ3B726 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms