Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NRF1Q16656 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NRF1Q16656 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NRF1Q16656 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NRF1Q16656 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NRF1Q16656 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NRF1Q16656 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NRF1Q16656 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NRF1Q16656 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NRF1Q16656 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NRF1Q16656 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NRF1Q16656 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NRF1Q16656 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NRF1Q16656 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NRF1Q16656 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NRF1Q16656 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NRF1Q16656 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NRF1Q16656 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
NRF1Q16656 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRF1Q16656 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms