Protein–RNA interactions for Protein: Q16623

STX1A, Syntaxin-1A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1AQ16623 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
STX1AQ16623 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
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