Protein–RNA interactions for Protein: Q16594

TAF9, Transcription initiation factor TFIID subunit 9, humanhuman

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF9Q16594 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
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