Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIK4Q16099 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIK4Q16099 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIK4Q16099 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIK4Q16099 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIK4Q16099 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIK4Q16099 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIK4Q16099 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIK4Q16099 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIK4Q16099 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIK4Q16099 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIK4Q16099 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIK4Q16099 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIK4Q16099 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIK4Q16099 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIK4Q16099 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIK4Q16099 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIK4Q16099 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIK4Q16099 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIK4Q16099 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIK4Q16099 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIK4Q16099 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIK4Q16099 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIK4Q16099 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIK4Q16099 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIK4Q16099 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIK4Q16099 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIK4Q16099 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIK4Q16099 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
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