Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SKIV2LQ15477 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms