Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

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Length 398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYTH1Q15438 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
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