Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RABEP1Q15276 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RABEP1Q15276 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
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