Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKD1Q15139 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
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