Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms