Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EBI3Q14213 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EBI3Q14213 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EBI3Q14213 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EBI3Q14213 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EBI3Q14213 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EBI3Q14213 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EBI3Q14213 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EBI3Q14213 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
EBI3Q14213 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EBI3Q14213 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EBI3Q14213 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EBI3Q14213 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EBI3Q14213 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EBI3Q14213 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EBI3Q14213 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EBI3Q14213 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EBI3Q14213 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EBI3Q14213 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EBI3Q14213 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EBI3Q14213 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EBI3Q14213 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EBI3Q14213 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EBI3Q14213 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EBI3Q14213 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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