Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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