Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms