Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
EXOSC2Q13868 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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EXOSC2Q13868 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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