Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CACNA1SQ13698 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
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