Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCGB2A2Q13296 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCGB2A2Q13296 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCGB2A2Q13296 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCGB2A2Q13296 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCGB2A2Q13296 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCGB2A2Q13296 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCGB2A2Q13296 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCGB2A2Q13296 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCGB2A2Q13296 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCGB2A2Q13296 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCGB2A2Q13296 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCGB2A2Q13296 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCGB2A2Q13296 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCGB2A2Q13296 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SCGB2A2Q13296 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCGB2A2Q13296 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCGB2A2Q13296 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SCGB2A2Q13296 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SCGB2A2Q13296 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SCGB2A2Q13296 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCGB2A2Q13296 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCGB2A2Q13296 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCGB2A2Q13296 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCGB2A2Q13296 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCGB2A2Q13296 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SCGB2A2Q13296 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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SCGB2A2Q13296 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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SCGB2A2Q13296 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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SCGB2A2Q13296 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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