Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SRSF6Q13247 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SRSF6Q13247 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SRSF6Q13247 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SRSF6Q13247 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SRSF6Q13247 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SRSF6Q13247 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SRSF6Q13247 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SRSF6Q13247 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SRSF6Q13247 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SRSF6Q13247 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SRSF6Q13247 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SRSF6Q13247 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SRSF6Q13247 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SRSF6Q13247 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SRSF6Q13247 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRSF6Q13247 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRSF6Q13247 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRSF6Q13247 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRSF6Q13247 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRSF6Q13247 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRSF6Q13247 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRSF6Q13247 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRSF6Q13247 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRSF6Q13247 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRSF6Q13247 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRSF6Q13247 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRSF6Q13247 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRSF6Q13247 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRSF6Q13247 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRSF6Q13247 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRSF6Q13247 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRSF6Q13247 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRSF6Q13247 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRSF6Q13247 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRSF6Q13247 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SRSF6Q13247 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRSF6Q13247 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRSF6Q13247 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRSF6Q13247 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRSF6Q13247 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRSF6Q13247 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRSF6Q13247 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRSF6Q13247 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRSF6Q13247 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRSF6Q13247 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRSF6Q13247 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRSF6Q13247 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRSF6Q13247 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRSF6Q13247 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRSF6Q13247 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRSF6Q13247 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRSF6Q13247 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRSF6Q13247 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRSF6Q13247 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRSF6Q13247 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRSF6Q13247 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRSF6Q13247 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRSF6Q13247 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRSF6Q13247 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRSF6Q13247 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SRSF6Q13247 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SRSF6Q13247 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SRSF6Q13247 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SRSF6Q13247 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SRSF6Q13247 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SRSF6Q13247 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SRSF6Q13247 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SRSF6Q13247 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SRSF6Q13247 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRSF6Q13247 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
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