Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
GRIN2BQ13224 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
GRIN2BQ13224 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
GRIN2BQ13224 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
GRIN2BQ13224 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
GRIN2BQ13224 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
GRIN2BQ13224 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
GRIN2BQ13224 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
GRIN2BQ13224 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
GRIN2BQ13224 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
GRIN2BQ13224 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
GRIN2BQ13224 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC35.32■■■■□ 3.24
GRIN2BQ13224 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
GRIN2BQ13224 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
GRIN2BQ13224 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
GRIN2BQ13224 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
GRIN2BQ13224 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
GRIN2BQ13224 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
GRIN2BQ13224 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
GRIN2BQ13224 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
GRIN2BQ13224 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
GRIN2BQ13224 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
GRIN2BQ13224 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
GRIN2BQ13224 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
GRIN2BQ13224 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
GRIN2BQ13224 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
GRIN2BQ13224 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
GRIN2BQ13224 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
GRIN2BQ13224 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
GRIN2BQ13224 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
GRIN2BQ13224 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
GRIN2BQ13224 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
GRIN2BQ13224 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
GRIN2BQ13224 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
GRIN2BQ13224 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
GRIN2BQ13224 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
GRIN2BQ13224 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
GRIN2BQ13224 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
GRIN2BQ13224 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
GRIN2BQ13224 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
GRIN2BQ13224 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
GRIN2BQ13224 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
GRIN2BQ13224 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
GRIN2BQ13224 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
GRIN2BQ13224 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
GRIN2BQ13224 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC35.29■■■■□ 3.24
GRIN2BQ13224 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
GRIN2BQ13224 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
GRIN2BQ13224 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
GRIN2BQ13224 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
GRIN2BQ13224 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
GRIN2BQ13224 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
GRIN2BQ13224 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
GRIN2BQ13224 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
GRIN2BQ13224 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
GRIN2BQ13224 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
GRIN2BQ13224 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
GRIN2BQ13224 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
GRIN2BQ13224 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
GRIN2BQ13224 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
GRIN2BQ13224 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
GRIN2BQ13224 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
GRIN2BQ13224 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
GRIN2BQ13224 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
GRIN2BQ13224 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
GRIN2BQ13224 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
GRIN2BQ13224 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
GRIN2BQ13224 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
GRIN2BQ13224 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC35.26■■■■□ 3.23
GRIN2BQ13224 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
GRIN2BQ13224 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
GRIN2BQ13224 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
GRIN2BQ13224 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
GRIN2BQ13224 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC35.24■■■■□ 3.23
GRIN2BQ13224 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
GRIN2BQ13224 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
GRIN2BQ13224 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
GRIN2BQ13224 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
GRIN2BQ13224 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
GRIN2BQ13224 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
GRIN2BQ13224 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
GRIN2BQ13224 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
GRIN2BQ13224 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
GRIN2BQ13224 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
GRIN2BQ13224 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
GRIN2BQ13224 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
GRIN2BQ13224 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC35.23■■■■□ 3.23
GRIN2BQ13224 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
GRIN2BQ13224 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
GRIN2BQ13224 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
GRIN2BQ13224 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
GRIN2BQ13224 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
GRIN2BQ13224 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
GRIN2BQ13224 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
GRIN2BQ13224 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
GRIN2BQ13224 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
GRIN2BQ13224 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
GRIN2BQ13224 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
GRIN2BQ13224 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
GRIN2BQ13224 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
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