Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPA4Q13156 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPA4Q13156 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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