Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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PRKAA1Q13131 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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PRKAA1Q13131 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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PRKAA1Q13131 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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PRKAA1Q13131 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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PRKAA1Q13131 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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PRKAA1Q13131 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PRKAA1Q13131 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRKAA1Q13131 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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PRKAA1Q13131 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRKAA1Q13131 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
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