Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
PRDM2Q13029 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
PRDM2Q13029 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
PRDM2Q13029 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
PRDM2Q13029 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
PRDM2Q13029 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
PRDM2Q13029 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
PRDM2Q13029 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
PRDM2Q13029 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
PRDM2Q13029 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
PRDM2Q13029 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.48
PRDM2Q13029 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
PRDM2Q13029 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
PRDM2Q13029 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
PRDM2Q13029 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
PRDM2Q13029 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
PRDM2Q13029 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC36.76■■■■□ 3.47
PRDM2Q13029 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.47
PRDM2Q13029 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC36.76■■■■□ 3.47
PRDM2Q13029 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
PRDM2Q13029 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.47
PRDM2Q13029 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.47
PRDM2Q13029 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
PRDM2Q13029 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
PRDM2Q13029 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.47
PRDM2Q13029 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
PRDM2Q13029 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PRDM2Q13029 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PRDM2Q13029 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
PRDM2Q13029 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PRDM2Q13029 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PRDM2Q13029 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PRDM2Q13029 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
PRDM2Q13029 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
PRDM2Q13029 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
PRDM2Q13029 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
PRDM2Q13029 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
PRDM2Q13029 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
PRDM2Q13029 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
PRDM2Q13029 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
PRDM2Q13029 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
PRDM2Q13029 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
PRDM2Q13029 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
PRDM2Q13029 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
PRDM2Q13029 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
PRDM2Q13029 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
PRDM2Q13029 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
PRDM2Q13029 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
PRDM2Q13029 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
PRDM2Q13029 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
PRDM2Q13029 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC36.72■■■■□ 3.47
PRDM2Q13029 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
PRDM2Q13029 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
PRDM2Q13029 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
PRDM2Q13029 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
PRDM2Q13029 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
PRDM2Q13029 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
PRDM2Q13029 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
PRDM2Q13029 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
PRDM2Q13029 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
PRDM2Q13029 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
PRDM2Q13029 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC36.71■■■■□ 3.47
PRDM2Q13029 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
PRDM2Q13029 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
PRDM2Q13029 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
PRDM2Q13029 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC36.7■■■■□ 3.47
PRDM2Q13029 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
PRDM2Q13029 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
PRDM2Q13029 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
PRDM2Q13029 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
PRDM2Q13029 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC36.69■■■■□ 3.46
PRDM2Q13029 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
PRDM2Q13029 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
PRDM2Q13029 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
PRDM2Q13029 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
PRDM2Q13029 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
PRDM2Q13029 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
PRDM2Q13029 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
PRDM2Q13029 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
PRDM2Q13029 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
PRDM2Q13029 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC36.68■■■■□ 3.46
PRDM2Q13029 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
PRDM2Q13029 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
PRDM2Q13029 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
PRDM2Q13029 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
PRDM2Q13029 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
PRDM2Q13029 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
PRDM2Q13029 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
PRDM2Q13029 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
PRDM2Q13029 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
PRDM2Q13029 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
PRDM2Q13029 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
PRDM2Q13029 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
PRDM2Q13029 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
PRDM2Q13029 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC36.66■■■■□ 3.46
PRDM2Q13029 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
PRDM2Q13029 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
PRDM2Q13029 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
PRDM2Q13029 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
PRDM2Q13029 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
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