Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN13Q12923 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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