Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB40BQ12829 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB40BQ12829 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB40BQ12829 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB40BQ12829 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB40BQ12829 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB40BQ12829 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB40BQ12829 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB40BQ12829 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB40BQ12829 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB40BQ12829 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB40BQ12829 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB40BQ12829 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB40BQ12829 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB40BQ12829 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB40BQ12829 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB40BQ12829 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB40BQ12829 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB40BQ12829 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB40BQ12829 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB40BQ12829 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB40BQ12829 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB40BQ12829 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB40BQ12829 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB40BQ12829 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB40BQ12829 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB40BQ12829 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB40BQ12829 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB40BQ12829 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB40BQ12829 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB40BQ12829 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB40BQ12829 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB40BQ12829 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB40BQ12829 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB40BQ12829 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB40BQ12829 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAB40BQ12829 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAB40BQ12829 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAB40BQ12829 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAB40BQ12829 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAB40BQ12829 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAB40BQ12829 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB40BQ12829 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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RAB40BQ12829 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB40BQ12829 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB40BQ12829 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB40BQ12829 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB40BQ12829 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB40BQ12829 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB40BQ12829 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB40BQ12829 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB40BQ12829 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB40BQ12829 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB40BQ12829 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB40BQ12829 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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RAB40BQ12829 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB40BQ12829 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB40BQ12829 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB40BQ12829 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB40BQ12829 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB40BQ12829 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB40BQ12829 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB40BQ12829 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB40BQ12829 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB40BQ12829 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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RAB40BQ12829 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
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RAB40BQ12829 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
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RAB40BQ12829 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB40BQ12829 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB40BQ12829 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB40BQ12829 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB40BQ12829 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB40BQ12829 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB40BQ12829 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB40BQ12829 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB40BQ12829 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB40BQ12829 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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RAB40BQ12829 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB40BQ12829 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB40BQ12829 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB40BQ12829 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB40BQ12829 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB40BQ12829 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB40BQ12829 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB40BQ12829 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB40BQ12829 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB40BQ12829 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB40BQ12829 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB40BQ12829 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB40BQ12829 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB40BQ12829 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB40BQ12829 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB40BQ12829 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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