Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMARCB1Q12824 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMARCB1Q12824 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
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