Protein–RNA interactions for Protein: Q12246

LCB4, Sphingoid long chain base kinase 4, yeastyeast

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LCB4Q12246 YBR071WYBR071W 636 nt3.85□□□□□ -1.79
LCB4Q12246 MTC4YBR255W 2085 nt3.85□□□□□ -1.79
LCB4Q12246 SAT4YCR008W 1812 nt3.84□□□□□ -1.79
LCB4Q12246 NAM2YLR382C 2685 nt3.84□□□□□ -1.79
LCB4Q12246 MON1YGL124C 1935 nt3.84□□□□□ -1.79
LCB4Q12246 MPO1YGL010W 525 nt3.84□□□□□ -1.79
LCB4Q12246 TAN1YGL232W 870 nt3.84□□□□□ -1.79
LCB4Q12246 RPL8AYHL033C 771 nt3.84□□□□□ -1.79
LCB4Q12246 RNR2YJL026W 1200 nt3.84□□□□□ -1.79
LCB4Q12246 SRP40YKR092C 1221 nt3.84□□□□□ -1.79
LCB4Q12246 YMR187CYMR187C 1296 nt3.84□□□□□ -1.79
LCB4Q12246 MPP6YNR024W 561 nt3.84□□□□□ -1.79
LCB4Q12246 BRX1YOL077C 876 nt3.84□□□□□ -1.79
LCB4Q12246 AGE1YDR524C 1449 nt3.84□□□□□ -1.79
LCB4Q12246 SWP82YFL049W 1872 nt3.84□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 TVP15YDR100W 432 nt3.83□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 RMD6YEL072W 696 nt3.83□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 COG2YGR120C 789 nt3.83□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 ECM34YHL043W 513 nt3.83□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 YIL024CYIL024C 570 nt3.83□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 YJR112W-AYJR112W-A 330 nt3.83□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 MIX23YBL107C 591 nt3.83□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 YOR186WYOR186W 435 nt3.83□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 FSH3YOR280C 801 nt3.83□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 YPR078CYPR078C 1119 nt3.83□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 PIN3YPR154W 648 nt3.83□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 AI4Q0065 1671 nt3.83□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 ACK1YDL203C 1872 nt3.83□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 NOG1YPL093W 1944 nt3.83□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 HCA4YJL033W 2313 nt3.83□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 ATG2YNL242W 4779 nt3.83□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 GIP4YAL031C 2283 nt3.82□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 FAT1YBR041W 2010 nt3.82□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 YML020WYML020W 1995 nt3.82□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 TDA1YMR291W 1761 nt3.82□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 TAF8YML114C 1533 nt3.82□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 CST9YLR394W 1449 nt3.82□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 PHO5YBR093C 1404 nt3.82□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 ERG9YHR190W 1335 nt3.82□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 ERP3YDL018C 678 nt3.82□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 OCA6YDR067C 675 nt3.82□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 YDR271CYDR271C 372 nt3.82□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 MAM1YER106W 909 nt3.82□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 YFL019CYFL019C 354 nt3.82□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 MAK16YAL025C 921 nt3.82□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 SDS22YKL193C 1017 nt3.82□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 NYV1YLR093C 762 nt3.82□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 SEC14YMR079W 915 nt3.82□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 SSO2YMR183C 888 nt3.82□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 YPR177CYPR177C 372 nt3.82□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 YBR242WYBR242W 717 nt3.82□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 TRS120YDR407C 3870 nt3.82□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 RIM1YCR028C-A 408 nt3.81□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 RSM18YER050C 417 nt3.81□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 YGR109W-AYGR109W-A 873 nt3.81□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 MRPL9YGR220C 810 nt3.81□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 YIL082WYIL082W 873 nt3.81□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 RLP24YLR009W 600 nt3.81□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt3.81□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 HNT3YOR258W 654 nt3.81□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 YOR364WYOR364W 369 nt3.81□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 YBR090CYBR090C 369 nt3.81□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 DBP3YGL078C 1572 nt3.8□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 YDR210W-AYDR210W-A 1317 nt3.8□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 YLR446WYLR446W 1302 nt3.8□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 HMRA1YCR097W 381 nt3.8□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 YDL032WYDL032W 312 nt3.8□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 DTD1YDL219W 453 nt3.8□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 YFH7YFR007W 1062 nt3.8□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 COX19YLL018C-A 297 nt3.8□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 ATP11YNL315C 957 nt3.8□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 YOL029CYOL029C 606 nt3.8□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 ARF3YOR094W 552 nt3.8□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 TRS20YBR254C 528 nt3.8□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 SEC27YGL137W 2670 nt3.8□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 NOP56YLR197W 1515 nt3.8□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 RDS2YPL133C 1341 nt3.79□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 MRH4YGL064C 1686 nt3.79□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 MNL1YHR204W 2391 nt3.79□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 NOP6YDL213C 678 nt3.79□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 SLX8YER116C 825 nt3.79□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 LOC1YFR001W 615 nt3.79□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 MND1YGL183C 660 nt3.79□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 YGR114CYGR114C 390 nt3.79□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 YHR182C-AYHR182C-A 474 nt3.79□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 YJL133C-AYJL133C-A 225 nt3.79□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 YLR050CYLR050C 486 nt3.79□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 YLR379WYLR379W 375 nt3.79□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 KAR4YCL055W 1008 nt3.79□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 ERG5YMR015C 1617 nt3.79□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 GPI13YLL031C 3054 nt3.79□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 PRP3YDR473C 1410 nt3.78□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 SNF2YOR290C 5112 nt3.78□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 ROK1YGL171W 1695 nt3.78□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 YBR238CYBR238C 2196 nt3.78□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 RPP1AYDL081C 321 nt3.78□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 Q0142Q0142 177 nt3.78□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 PTI1YGR156W 1278 nt3.78□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 PRS3YHL011C 963 nt3.78□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 CFD1YIL003W 882 nt3.78□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.3 ms