Protein–RNA interactions for Protein: Q12193

TY1B-BR, Transposon Ty1-BR Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 1,756 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-BRQ12193 SYM1YLR251W 594 nt3.08□□□□□ -1.92
TY1B-BRQ12193 SET2YJL168C 2202 nt3.08□□□□□ -1.92
TY1B-BRQ12193 IRR1YIL026C 3453 nt3.08□□□□□ -1.92
TY1B-BRQ12193 YDR149CYDR149C 708 nt3.07□□□□□ -1.92
TY1B-BRQ12193 PDX1YGR193C 1233 nt3.07□□□□□ -1.92
TY1B-BRQ12193 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt3.07□□□□□ -1.92
TY1B-BRQ12193 RPS7AYOR096W 573 nt3.07□□□□□ -1.92
TY1B-BRQ12193 SEC6YIL068C 2418 nt3.07□□□□□ -1.92
TY1B-BRQ12193 SQS1YNL224C 2304 nt3.07□□□□□ -1.92
TY1B-BRQ12193 ARP5YNL059C 2268 nt3.07□□□□□ -1.92
TY1B-BRQ12193 UTP15YMR093W 1542 nt3.07□□□□□ -1.92
TY1B-BRQ12193 THO1YER063W 657 nt3.07□□□□□ -1.92
TY1B-BRQ12193 YGL132WYGL132W 336 nt3.07□□□□□ -1.92
TY1B-BRQ12193 YGR073CYGR073C 372 nt3.07□□□□□ -1.92
TY1B-BRQ12193 YLL044WYLL044W 447 nt3.07□□□□□ -1.92
TY1B-BRQ12193 DUG3YNL191W 1074 nt3.07□□□□□ -1.92
TY1B-BRQ12193 YPL088WYPL088W 1029 nt3.07□□□□□ -1.92
TY1B-BRQ12193 FKS1YLR342W 5631 nt3.07□□□□□ -1.92
TY1B-BRQ12193 MPH1YIR002C 2982 nt3.06□□□□□ -1.92
TY1B-BRQ12193 UBR2YLR024C 5619 nt3.06□□□□□ -1.92
TY1B-BRQ12193 DYN2YDR424C 279 nt3.06□□□□□ -1.92
TY1B-BRQ12193 DGR1YNL130C-A 147 nt3.06□□□□□ -1.92
TY1B-BRQ12193 YAT2YER024W 2772 nt3.06□□□□□ -1.92
TY1B-BRQ12193 NSA1YGL111W 1392 nt3.06□□□□□ -1.92
TY1B-BRQ12193 PTR3YFR029W 2037 nt3.05□□□□□ -1.92
TY1B-BRQ12193 MRP8YKL142W 660 nt3.05□□□□□ -1.92
TY1B-BRQ12193 YKT6YKL196C 603 nt3.05□□□□□ -1.92
TY1B-BRQ12193 YPR053CYPR053C 456 nt3.05□□□□□ -1.92
TY1B-BRQ12193 YNL193WYNL193W 1677 nt3.05□□□□□ -1.92
TY1B-BRQ12193 PIK1YNL267W 3201 nt3.05□□□□□ -1.92
TY1B-BRQ12193 RSN1YMR266W 2862 nt3.05□□□□□ -1.92
TY1B-BRQ12193 YDR209CYDR209C 414 nt3.05□□□□□ -1.92
TY1B-BRQ12193 MRPL38YKL170W 417 nt3.05□□□□□ -1.92
TY1B-BRQ12193 TIF4631YGR162W 2859 nt3.05□□□□□ -1.92
TY1B-BRQ12193 YGR168CYGR168C 1131 nt3.04□□□□□ -1.92
TY1B-BRQ12193 CDC24YAL041W 2565 nt3.04□□□□□ -1.92
TY1B-BRQ12193 RPN4YDL020C 1596 nt3.04□□□□□ -1.92
TY1B-BRQ12193 RBK1YCR036W 1002 nt3.03□□□□□ -1.92
TY1B-BRQ12193 YHR137C-AYHR137C-A 651 nt3.03□□□□□ -1.92
TY1B-BRQ12193 YKL091CYKL091C 933 nt3.03□□□□□ -1.92
TY1B-BRQ12193 YIG1YPL201C 1386 nt3.03□□□□□ -1.92
TY1B-BRQ12193 TAF2YCR042C 4224 nt3.03□□□□□ -1.92
TY1B-BRQ12193 ERG9YHR190W 1335 nt3.03□□□□□ -1.92
TY1B-BRQ12193 YHP1YDR451C 1062 nt3.02□□□□□ -1.93
TY1B-BRQ12193 YKR015CYKR015C 1707 nt3.02□□□□□ -1.93
TY1B-BRQ12193 PRT1YOR361C 2292 nt3.02□□□□□ -1.93
TY1B-BRQ12193 SUC2YIL162W 1599 nt3.02□□□□□ -1.93
TY1B-BRQ12193 BRE1YDL074C 2103 nt3.02□□□□□ -1.93
TY1B-BRQ12193 YDR249CYDR249C 1122 nt3.02□□□□□ -1.93
TY1B-BRQ12193 YNR071CYNR071C 1029 nt3.02□□□□□ -1.93
TY1B-BRQ12193 ISU1YPL135W 498 nt3.02□□□□□ -1.93
TY1B-BRQ12193 UBP2YOR124C 3819 nt3.01□□□□□ -1.93
TY1B-BRQ12193 APL4YPR029C 2499 nt3.01□□□□□ -1.93
TY1B-BRQ12193 PFA5YDR459C 1125 nt3.01□□□□□ -1.93
TY1B-BRQ12193 YKR051WYKR051W 1257 nt3.01□□□□□ -1.93
TY1B-BRQ12193 MIP6YHR015W 1980 nt3.01□□□□□ -1.93
TY1B-BRQ12193 RPS28BYLR264W 204 nt3□□□□□ -1.93
TY1B-BRQ12193 IDI1YPL117C 867 nt3□□□□□ -1.93
TY1B-BRQ12193 TRS130YMR218C 3309 nt3□□□□□ -1.93
TY1B-BRQ12193 YHL037CYHL037C 402 nt3□□□□□ -1.93
TY1B-BRQ12193 CPR7YJR032W 1182 nt3□□□□□ -1.93
TY1B-BRQ12193 YAL065CYAL065C 387 nt3□□□□□ -1.93
TY1B-BRQ12193 MST28YAR033W 705 nt3□□□□□ -1.93
TY1B-BRQ12193 YPL142CYPL142C 318 nt3□□□□□ -1.93
TY1B-BRQ12193 YBR300CYBR300C 498 nt3□□□□□ -1.93
TY1B-BRQ12193 PMT4YJR143C 2289 nt3□□□□□ -1.93
TY1B-BRQ12193 TEC1YBR083W 1461 nt2.99□□□□□ -1.93
TY1B-BRQ12193 ETP1YHL010C 1758 nt2.99□□□□□ -1.93
TY1B-BRQ12193 DNL4YOR005C 2835 nt2.99□□□□□ -1.93
TY1B-BRQ12193 YER172C-AYER172C-A 381 nt2.99□□□□□ -1.93
TY1B-BRQ12193 YGL101WYGL101W 648 nt2.99□□□□□ -1.93
TY1B-BRQ12193 ARC19YKL013C 516 nt2.99□□□□□ -1.93
TY1B-BRQ12193 TVP18YMR071C 504 nt2.99□□□□□ -1.93
TY1B-BRQ12193 SAK1YER129W 3429 nt2.98□□□□□ -1.93
TY1B-BRQ12193 MET5YJR137C 4329 nt2.98□□□□□ -1.93
TY1B-BRQ12193 YCG1YDR325W 3108 nt2.98□□□□□ -1.93
TY1B-BRQ12193 YGR226CYGR226C 210 nt2.98□□□□□ -1.93
TY1B-BRQ12193 CUS2YNL286W 858 nt2.98□□□□□ -1.93
TY1B-BRQ12193 YAP7YOL028C 738 nt2.98□□□□□ -1.93
TY1B-BRQ12193 BUD21YOR078W 645 nt2.98□□□□□ -1.93
TY1B-BRQ12193 YPR147CYPR147C 915 nt2.98□□□□□ -1.93
TY1B-BRQ12193 CBP2YHL038C 1893 nt2.98□□□□□ -1.93
TY1B-BRQ12193 SXM1YDR395W 2835 nt2.98□□□□□ -1.93
TY1B-BRQ12193 MGT1YDL200C 567 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1B-BRQ12193 RTN1YDR233C 888 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1B-BRQ12193 YDR442WYDR442W 393 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1B-BRQ12193 SLX8YER116C 825 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1B-BRQ12193 LST7YGR057C 729 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1B-BRQ12193 AIM19YIL087C 474 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1B-BRQ12193 GCY1YOR120W 939 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1B-BRQ12193 MSS116YDR194C 1995 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1B-BRQ12193 ERB1YMR049C 2424 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1B-BRQ12193 FLO11YIR019C 4104 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1B-BRQ12193 RRM3YHR031C 2172 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1B-BRQ12193 DYN1YKR054C 12279 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1B-BRQ12193 ASP1YDR321W 1146 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1B-BRQ12193 ADH4YGL256W 1149 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1B-BRQ12193 RPS31YLR167W 459 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1B-BRQ12193 RPS11BYBR048W 471 nt2.97□□□□□ -1.93
TY1B-BRQ12193 CFT1YDR301W 4074 nt2.96□□□□□ -1.93
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