Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CGNL1Q0VF96 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms