Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
APOBRQ0VD83 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOBRQ0VD83 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms