Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAGPQ0VAQ4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms