Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RIPPLY1Q0D2K3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms