Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCBP1Q09161 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms