Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBBP4Q09028 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms