Protein–RNA interactions for Protein: Q08ER8

ZNF543, Zinc finger protein 543, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF543Q08ER8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms