Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SSRP1Q08945 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SSRP1Q08945 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SSRP1Q08945 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SSRP1Q08945 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SSRP1Q08945 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SSRP1Q08945 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SSRP1Q08945 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SSRP1Q08945 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SSRP1Q08945 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SSRP1Q08945 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SSRP1Q08945 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SSRP1Q08945 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SSRP1Q08945 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SSRP1Q08945 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SSRP1Q08945 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SSRP1Q08945 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SSRP1Q08945 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SSRP1Q08945 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SSRP1Q08945 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SSRP1Q08945 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SSRP1Q08945 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SSRP1Q08945 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SSRP1Q08945 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SSRP1Q08945 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SSRP1Q08945 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SSRP1Q08945 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SSRP1Q08945 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SSRP1Q08945 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SSRP1Q08945 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SSRP1Q08945 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SSRP1Q08945 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SSRP1Q08945 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SSRP1Q08945 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SSRP1Q08945 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SSRP1Q08945 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SSRP1Q08945 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SSRP1Q08945 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SSRP1Q08945 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SSRP1Q08945 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SSRP1Q08945 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SSRP1Q08945 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SSRP1Q08945 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SSRP1Q08945 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SSRP1Q08945 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SSRP1Q08945 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SSRP1Q08945 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SSRP1Q08945 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SSRP1Q08945 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SSRP1Q08945 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SSRP1Q08945 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SSRP1Q08945 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SSRP1Q08945 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SSRP1Q08945 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SSRP1Q08945 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SSRP1Q08945 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SSRP1Q08945 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SSRP1Q08945 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SSRP1Q08945 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SSRP1Q08945 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SSRP1Q08945 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SSRP1Q08945 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SSRP1Q08945 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SSRP1Q08945 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SSRP1Q08945 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SSRP1Q08945 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SSRP1Q08945 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SSRP1Q08945 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SSRP1Q08945 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SSRP1Q08945 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSRP1Q08945 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms