Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDR1Q08345 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDR1Q08345 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDR1Q08345 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDR1Q08345 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDR1Q08345 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDR1Q08345 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDR1Q08345 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
DDR1Q08345 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDR1Q08345 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDR1Q08345 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDR1Q08345 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDR1Q08345 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDR1Q08345 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDR1Q08345 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDR1Q08345 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDR1Q08345 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDR1Q08345 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
DDR1Q08345 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDR1Q08345 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDR1Q08345 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
DDR1Q08345 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDR1Q08345 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
DDR1Q08345 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDR1Q08345 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDR1Q08345 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDR1Q08345 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDR1Q08345 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDR1Q08345 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDR1Q08345 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDR1Q08345 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDR1Q08345 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDR1Q08345 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDR1Q08345 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
DDR1Q08345 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
DDR1Q08345 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDR1Q08345 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDR1Q08345 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDR1Q08345 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
DDR1Q08345 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDR1Q08345 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDR1Q08345 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDR1Q08345 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDR1Q08345 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDR1Q08345 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDR1Q08345 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDR1Q08345 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDR1Q08345 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDR1Q08345 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDR1Q08345 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDR1Q08345 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDR1Q08345 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDR1Q08345 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDR1Q08345 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDR1Q08345 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDR1Q08345 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDR1Q08345 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDR1Q08345 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDR1Q08345 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDR1Q08345 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDR1Q08345 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
DDR1Q08345 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDR1Q08345 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDR1Q08345 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
DDR1Q08345 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDR1Q08345 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
DDR1Q08345 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDR1Q08345 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms