Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TGM3Q08188 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TGM3Q08188 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms