Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
SCN1BQ07699 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms