Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
CHRNDQ07001 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHRNDQ07001 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHRNDQ07001 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHRNDQ07001 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHRNDQ07001 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHRNDQ07001 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHRNDQ07001 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHRNDQ07001 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CHRNDQ07001 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CHRNDQ07001 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHRNDQ07001 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHRNDQ07001 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHRNDQ07001 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHRNDQ07001 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHRNDQ07001 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHRNDQ07001 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHRNDQ07001 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHRNDQ07001 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHRNDQ07001 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHRNDQ07001 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHRNDQ07001 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHRNDQ07001 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHRNDQ07001 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHRNDQ07001 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHRNDQ07001 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CHRNDQ07001 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHRNDQ07001 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CHRNDQ07001 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHRNDQ07001 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHRNDQ07001 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHRNDQ07001 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHRNDQ07001 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHRNDQ07001 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHRNDQ07001 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CHRNDQ07001 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHRNDQ07001 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CHRNDQ07001 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHRNDQ07001 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHRNDQ07001 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHRNDQ07001 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHRNDQ07001 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHRNDQ07001 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHRNDQ07001 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CHRNDQ07001 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CHRNDQ07001 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHRNDQ07001 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHRNDQ07001 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHRNDQ07001 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHRNDQ07001 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHRNDQ07001 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CHRNDQ07001 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHRNDQ07001 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHRNDQ07001 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHRNDQ07001 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHRNDQ07001 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CHRNDQ07001 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CHRNDQ07001 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHRNDQ07001 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHRNDQ07001 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHRNDQ07001 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHRNDQ07001 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHRNDQ07001 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms