Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EMX2Q04743 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms