Protein–RNA interactions for Protein: Q02962

PAX2, Paired box protein Pax-2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX2Q02962 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms