Protein–RNA interactions for Protein: Q02446

SP4, Transcription factor Sp4, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP4Q02446 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SP4Q02446 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SP4Q02446 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SP4Q02446 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SP4Q02446 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SP4Q02446 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SP4Q02446 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SP4Q02446 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SP4Q02446 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SP4Q02446 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SP4Q02446 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SP4Q02446 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SP4Q02446 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SP4Q02446 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SP4Q02446 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SP4Q02446 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SP4Q02446 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SP4Q02446 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SP4Q02446 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SP4Q02446 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SP4Q02446 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SP4Q02446 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SP4Q02446 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SP4Q02446 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SP4Q02446 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SP4Q02446 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SP4Q02446 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SP4Q02446 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SP4Q02446 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SP4Q02446 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SP4Q02446 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SP4Q02446 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SP4Q02446 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SP4Q02446 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SP4Q02446 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SP4Q02446 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SP4Q02446 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SP4Q02446 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SP4Q02446 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SP4Q02446 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SP4Q02446 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SP4Q02446 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SP4Q02446 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SP4Q02446 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SP4Q02446 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SP4Q02446 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SP4Q02446 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SP4Q02446 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SP4Q02446 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SP4Q02446 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SP4Q02446 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SP4Q02446 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SP4Q02446 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SP4Q02446 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SP4Q02446 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SP4Q02446 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SP4Q02446 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SP4Q02446 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SP4Q02446 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SP4Q02446 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SP4Q02446 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SP4Q02446 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SP4Q02446 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SP4Q02446 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SP4Q02446 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SP4Q02446 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SP4Q02446 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SP4Q02446 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SP4Q02446 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SP4Q02446 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SP4Q02446 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SP4Q02446 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SP4Q02446 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SP4Q02446 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SP4Q02446 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SP4Q02446 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SP4Q02446 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SP4Q02446 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SP4Q02446 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SP4Q02446 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SP4Q02446 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SP4Q02446 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SP4Q02446 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SP4Q02446 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SP4Q02446 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SP4Q02446 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SP4Q02446 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SP4Q02446 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SP4Q02446 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SP4Q02446 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SP4Q02446 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SP4Q02446 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SP4Q02446 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SP4Q02446 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SP4Q02446 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SP4Q02446 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SP4Q02446 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SP4Q02446 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SP4Q02446 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SP4Q02446 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms