Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EXOSC10Q01780 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EXOSC10Q01780 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EXOSC10Q01780 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EXOSC10Q01780 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EXOSC10Q01780 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EXOSC10Q01780 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EXOSC10Q01780 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EXOSC10Q01780 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EXOSC10Q01780 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EXOSC10Q01780 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EXOSC10Q01780 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EXOSC10Q01780 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EXOSC10Q01780 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EXOSC10Q01780 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EXOSC10Q01780 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EXOSC10Q01780 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EXOSC10Q01780 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
EXOSC10Q01780 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EXOSC10Q01780 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EXOSC10Q01780 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EXOSC10Q01780 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EXOSC10Q01780 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EXOSC10Q01780 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EXOSC10Q01780 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EXOSC10Q01780 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EXOSC10Q01780 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EXOSC10Q01780 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EXOSC10Q01780 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EXOSC10Q01780 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EXOSC10Q01780 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EXOSC10Q01780 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EXOSC10Q01780 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EXOSC10Q01780 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EXOSC10Q01780 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EXOSC10Q01780 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EXOSC10Q01780 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EXOSC10Q01780 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EXOSC10Q01780 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EXOSC10Q01780 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EXOSC10Q01780 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EXOSC10Q01780 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EXOSC10Q01780 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EXOSC10Q01780 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EXOSC10Q01780 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EXOSC10Q01780 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EXOSC10Q01780 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EXOSC10Q01780 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EXOSC10Q01780 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EXOSC10Q01780 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EXOSC10Q01780 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EXOSC10Q01780 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EXOSC10Q01780 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EXOSC10Q01780 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EXOSC10Q01780 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EXOSC10Q01780 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms