Protein–RNA interactions for Protein: Q00266

MAT1A, S-adenosylmethionine synthase isoform type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAT1AQ00266 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms