Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms