Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRX3P78415 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
IRX3P78415 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRX3P78415 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRX3P78415 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRX3P78415 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRX3P78415 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRX3P78415 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRX3P78415 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
IRX3P78415 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRX3P78415 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRX3P78415 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
IRX3P78415 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRX3P78415 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRX3P78415 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRX3P78415 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRX3P78415 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRX3P78415 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRX3P78415 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
IRX3P78415 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
IRX3P78415 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRX3P78415 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRX3P78415 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRX3P78415 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRX3P78415 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRX3P78415 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRX3P78415 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRX3P78415 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRX3P78415 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRX3P78415 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
IRX3P78415 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRX3P78415 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
IRX3P78415 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRX3P78415 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
IRX3P78415 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRX3P78415 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRX3P78415 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRX3P78415 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRX3P78415 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRX3P78415 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRX3P78415 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRX3P78415 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
IRX3P78415 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRX3P78415 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRX3P78415 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRX3P78415 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRX3P78415 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRX3P78415 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRX3P78415 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRX3P78415 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRX3P78415 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRX3P78415 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRX3P78415 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRX3P78415 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRX3P78415 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRX3P78415 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRX3P78415 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRX3P78415 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRX3P78415 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRX3P78415 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRX3P78415 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRX3P78415 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRX3P78415 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRX3P78415 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRX3P78415 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRX3P78415 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRX3P78415 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRX3P78415 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRX3P78415 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRX3P78415 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
IRX3P78415 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRX3P78415 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
IRX3P78415 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
IRX3P78415 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
IRX3P78415 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
IRX3P78415 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRX3P78415 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRX3P78415 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRX3P78415 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRX3P78415 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRX3P78415 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRX3P78415 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRX3P78415 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRX3P78415 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
IRX3P78415 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRX3P78415 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRX3P78415 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRX3P78415 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRX3P78415 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRX3P78415 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRX3P78415 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRX3P78415 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRX3P78415 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRX3P78415 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRX3P78415 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRX3P78415 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRX3P78415 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRX3P78415 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRX3P78415 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRX3P78415 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms