Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms