Protein–RNA interactions for Protein: P62875

POLR2L, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2LP62875 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR2LP62875 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
POLR2LP62875 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
POLR2LP62875 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
POLR2LP62875 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR2LP62875 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR2LP62875 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR2LP62875 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR2LP62875 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR2LP62875 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR2LP62875 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR2LP62875 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR2LP62875 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.32■■□□□ 1
POLR2LP62875 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR2LP62875 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR2LP62875 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR2LP62875 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2LP62875 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2LP62875 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2LP62875 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2LP62875 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2LP62875 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2LP62875 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2LP62875 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2LP62875 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2LP62875 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2LP62875 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2LP62875 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.31■■□□□ 1
POLR2LP62875 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2LP62875 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2LP62875 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2LP62875 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.31■■□□□ 1
POLR2LP62875 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2LP62875 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2LP62875 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2LP62875 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2LP62875 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2LP62875 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2LP62875 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2LP62875 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2LP62875 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2LP62875 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2LP62875 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2LP62875 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2LP62875 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.3■■□□□ 1
POLR2LP62875 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2LP62875 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2LP62875 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.29■■□□□ 1
POLR2LP62875 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2LP62875 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2LP62875 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2LP62875 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2LP62875 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2LP62875 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2LP62875 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.29■■□□□ 1
POLR2LP62875 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2LP62875 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms